Die Akademie fokussiert ihre Arbeit auf drei Themenschwerpunkte, denen die Projekte zugeordnet sind. Hinzu kommen Sonderprojekte, die sich nicht innerhalb der normalen acatech Projektstruktur durchführen lassen und sonstige Projekte. Schließlich führt acatech gemeinsam mit der Nationalen Akademie der Wissenschaften und den Unionsakademien Projekte zur Politikberatung durch, die vom Ständigen Ausschuss der Nationalen Akademie koordiniert werden.